De novo (Bacteria & Fungi)

概要

ゲノム配列未知の真正細菌・古細菌・真菌を対象として、全ゲノム配列をシーケンシングします。ゲノム解析の大幅なコストダウンにより、全ゲノム解析がより安価にご提供できるようになりました。ゲノムの機能解析、進化、比較ゲノムや薬品開発・エネルギー産業研究に応用していただけます。

特徴

  • ゲノム配列を組み立てることにより、解析対象生物の遺伝的なイメージの「全体像」を見ることができます。
  • 遺伝子予測・遺伝子機能分類・比較ゲノム解析サービスもご用意しております。ご要望に合わせてアノテーションや機能解析などのバイオインフォマティクス解析を行います。

サンプル条件 (詳しくは、ご相談下さい。)

サービス内容

  1. お預かりしたサンプルの品質を確認します。
  2. DNAを断片化し、末端処理・アダプター付加を行います。
  3. 変性処理により1本鎖になったDNAをフローセル上に結合させ、増幅してライブラリーを作成します。
  4. 作成したライブラリーをペアエンド法でシーケンシングします。

 

 

納品物

  1. シーケンシング結果(fastqフォーマットファイル、未加工のものおよび加工(※1)したもの)
  2. シーケンスの統計情報、カバレッジの分析結果、アセンブリされたcontig配列(オプション)
  3. アノテーション結果(オプション)
  4. その他バイオインフォマティクス解析結果(オプション)

 

(※1) アダプター配列の除去、N塩基の除去、クオリティの低いリード配列の除去などを行います。