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B細胞受容体シーケンシング
B細胞受容体シーケンシング

解析バックグラウンド

B細胞受容体とは

B細胞表面に発現するB細胞受容体(BCR)は、免疫グロブリン(Ig)受容体とも呼ばれ、多種多様な外部抗原を特異的に認識する分子として、獲得免疫システムにおける重要な役割を担っています。
BCRは免疫グロブリンH 鎖(IgH)、免疫グロブリンL鎖(IgK/IgL)の2つのペプチド鎖で構成されており、Bリンパ球の抗原特異性は主にB細胞受容体の超可変的相補性決定領域3(CDR3)のアミノ酸配列によって決定されます。

遺伝子再構成によるB細胞受容体の多様性

B細胞はその分化過程で免疫グロブリン遺伝子のV(D)J断片組換え(再構成)が起こります。ゲノムDNA上には複数のVおよびJ遺伝子セグメントが存在しているため、その組み合わせにより、多様なBCRが形成されます。さらに、超可変的領域のCDR3には、L鎖のV-J、H鎖のV-DおよびD-J接合部での非テンプレート配列挿入・削除や体細胞超変異などが含まれるため、受容体の潜在的な多様性が増加します。

こうした受容体の潜在的多様性により、特定のCDR3配列を有するB細胞に偏って存在する可能性は非常に低く、膨大な種類からなる各CDR3配列が実質的にB細胞クローンを識別できる固有のタグとなります。

解析原理

多様なB細胞受容体のハイスループットシーケンシング

clonoSEQ®は、再構成されたBCRCDR3配列を増幅してIgH(VDJ)、IgH(DJ)およびIgK/L遺伝子座の再構成、ならびにBCL1/IgH(J)およびBCL2/IgH(J)の転座を解析するマルチプレックスPCR法をベースとしたBCRシーケンシングです。 BCRシーケンシングにより、クロナリティを評価し、追跡可能な腫瘍特異的BCRCDR3配列(ドミナントシーケンス)を同定します。腫瘍特異的配列の同定後、フォローアップサンプルにおいてBリンパ球のクローン性を評価し、ドミナントシーケンスの検出と定量化、およびその他特徴的なBCRCDR3配列を調べることによりMRDを評価します。

clonoSEQ®は、多様なBCRCDR3配列の網羅的解析に対応するため、VおよびJセグメントに設計された複数のプライマーを使用し、マルチプレックスPCRを行います。

本解析は研究用です。診断・検査に用いることはできません。clonoSEQは、Adaptive Biotechnologies Corp.の登録商標です。 Adaptive BiotechnologiesはAdaptive Biotechnologies Corp.の商標です。本パンフレットに記載されている商品名等は、特に記載はなくても各社の商標、または登録商標です。本パンフレットの内容の一部または全部を無断で転載あるいは複製することはご遠慮ください。

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