GenDx HLAタイピング/キメリズム

GenDx HLAタイピング/キメリズム

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製品概要

高解像度HLAタイピングのグローバルリーダーであるGenDx社(オランダ、ユトレヒト)が開発・製造する移植関連製品で、世界60か国以上で販売されています。次世代シーケンス法やサンガー法によるHLAタイピングのための試薬および解析ソフトウェアを各種取り揃えています。 また、qPCR法による移植後のキメリズムモニタリングのための製品も提供しています。

次世代シーケンス法によるHLAタイピング

NGS用のHLAタイピング試薬と解析ソフトウェアです。各メーカーのNGSプラットフォーム(イルミナ社MiSeq、サーモフィッシャーサイエンティフィック社IonTorrent、パシフィックバイオサイエンス社PacBio® RS IIなど)に対応したワークフローをご提案可能です。ワークフローの各過程(Amplificatin、Library preparation、Analysis software)およびプラットフォームごとに製品を提供しています。


Amplification

    対象となるHLA遺伝子座をPCR増幅するための試薬です。Singleplex増幅用とMultiplex増幅用の試薬を販売しています。


  • NGSgo®-AmpX v2

  • ・主な構成試薬;HLAの各遺伝子座をターゲットとしたSingleplex増幅用プライマー、PCR試薬(GenDx-LongMix)。
    ・対象HLA遺伝子座:A, B, C, DRB1, DQB1, DPA1, DPB1, DQA1, DRB3/4/5(PacBio用のフローではDRB3/4/5が除外)。
    ※各遺伝子座の対象領域はメーカーサイトでご確認下さい。
    ・各NGSプラットフォームに対応したフローで、ご使用いただけます。


  • NGSgo®-AmpX

  • ・主な構成試薬:HLAの各遺伝子座をターゲットとしたSingleplex増幅用プライマー(PCR試薬は別売)。
    ・対象HLA遺伝子座:A, B, C, DRB1, DQB1, DPA1, DPB1, DQA1, DRB3/4/5(PacBio用のフローではDRB3/4/5が除外)。
    ※各遺伝子座の対象領域はメーカーサイトでご確認下さい。
    ・各NGSプラットフォームに対応したフローで、ご使用いただけます。


  • NGSgo®-MX6-1

  • ・主な構成試薬:HLAの6遺伝子座をターゲットとしたMultiplex増幅用プライマー、PCR試薬(GenDx-LongMix)。
    ・対象HLA遺伝子座:A, B, C, DRB1, DQB1, DPB1。
    ※各遺伝子座の対象領域はメーカーサイトでご確認下さい。
    ・One-Day-Workflow対応製品です。
    ・イルミナプラットフォームでのみ検証済です。


  • GenDx-LongRange PCR Kits

  • ・ターゲット増幅用LongRange PCR試薬です。
    ・NGSgo®-AmpXと共にご使用下さい。


  • GenDx-LongMix

  • ・PCR酵素、dNTP、バッファーを含むLongRange PCR用マスターミックスです。
    ・NGSgo®-AmpX v2などと共にご使用下さい。


 

Library preparation

    NGSライブラリを作製するための試薬です。イルミナプラットフォーム用およびIonTorrent用試薬を販売しています。


  • NGSgo®-LibrX

  • ・ライブラリ作製用試薬です(アダプターとIndex配列付プライマーは別売)。
    ・イルミナプラットフォーム用およびIonTorrent用試薬をご提供します。


  • NGSgo®-IndX

  • ・ライブラリ作製用のアダプターおよびIndex配列付プライマーです(IonTorrent用はアダプターのみ)。
    ・イルミナプラットフォーム用(24, 96, 384 index)およびIonTorrent用(24, 48 index)試薬をご提供します。


  • NGSgo®-IndX Adapters & Indices Illumina plates

  • ・ライブラリ作製用Index配列付プライマーの96ウェルプレートフォーマット製品です(アダプターも付属)。
    ・最大384種類のDual indexが使用可能です。
    ・より簡便で迅速なフローを実現すると共に、分注時のIndexの組み合わせ間違いを削減します。
    ・必要なサンプル数分のみ使用でき、未使用分は保存できます。
    ・イルミナプラットフォーム用製品です。


  • NGS-go®-IndX Adapter Ion Torrent plate

  • ・ライブラリ作製用Index配列付アダプターの96ウェルプレートフォーマット製品です。
    ・96種類のindexが使用可能です。
    ・必要なサンプル数分のみ使用でき、未使用分は保存できます。
    ・Ion Torrent用製品です。


 

Analysis software

    HLAタイピングのためのNGSデータ解析用ソフトウェアです。


  • NGSengine®

  • ・NGSを用いたHLAタイピングのデータ解析とタイピング結果閲覧・判定のためのソフトウェアです。
    ・操作性と解析スピードに優れ、各メーカーのNGSプラットフォームで得られたシーケンスデータを解析できます。
    ・通常のラップトップまたはデスクトップPCでお使いいただけます。
    ※ご使用頂く際は、メーカーサイトに記載されたシステム要件を満たすPCをご準備下さい。
    ・Free Trial:無料で一定期間お試しいただけます。ご希望の場合は、メーカーサイトよりお申込みいただくか、弊社 “お問合せ”サイトよりご連絡ください。


  • NGSignition®

  • ・シーケンシングラン終了後、NGSengine®によるデータ解析を自動的に開始するためのソフトウェアです。
    ・シーケンサーのoutput folder をモニターし、ランが終了するとNGSengine®(自動化対応バージョン)によるデータ解析がスタートします。解析終了後はNGSengineで解析結果を確認できます。
    ・One-Day-Workflow対応製品です。


     

    サンガーシーケンス用のHLAタイピング試薬と解析ソフトウェアです。


  • SBTexcellerator®

  • ・サンガーシーケンス用のHLAタイピング試薬です。
    ・主な構成試薬:HLAの各遺伝子座をターゲットとしたPCR増幅用プライマーおよびシーケンシングプライマー。
    ・対象HLA遺伝子座:A, B, C, DPA1, DPB1, DQA1, DQB1, DRB1, DRB3/4/5, G
    ※各遺伝子座の対象領域はメーカーサイトでご確認下さい。
    ・ターゲット増幅用PCR試薬(GenDx-LongRangeまたはGenDx-LongMix SBTX)、クリーンアップ試薬(GenDx-ExoSAP)、シーケンシング試薬(GenDx-BigDye)は別売です。


  • AlleleSEQR®


  • ・サンガーシーケンス用のHLAタイピング試薬です。
    ・主な構成試薬:HLAの各遺伝子座をターゲットとしたPCR増幅用プレミックス試薬、PCR酵素、クリーンアップ試薬、各シーケンシングプライマーごとのシーケンシングミックス試薬。
    ・対象HLA遺伝子座:A, B, C, DPB1, DQB1, DRB1
    ※各遺伝子座の対象領域はメーカーサイトでご確認下さい。
    ・Celera社が開発したAlleleSEQRを、GenDx社が継続して提供いたします。


  • SBTengine®

  • ・SBTexcellerator、AlleleSEQRに対応するサンガーシーケンス用のHLAタイピングソフトウェアです。アンビギュイティ(ambiguity)※1に対しては、自動で解決法を提示します。
    ・Free Trial:無料で一定期間お試しいただけます。ご希望の場合は、メーカーサイトよりお申込みいただくか、弊社 “お問合せ”サイトよりご連絡ください。
    ※1 HLAタイピングの結果で判別できないアリルが2種類以上存在する場合。


     

    移植後のレシピエントのキメリズムをモニタリングするための試薬とソフトウェアです。39のマーカーからキメリズムモニタリングに使用可能なマーカーを選択した後、移植後のレシピエントDNA(またはドナーDNA)の相対量をモニタリングします。高感度なqPCR法を採用(LOD: 0.05%)することで、より低レベルのキメリズムをモニタリングでき、より早期に再発を検出することが期待されます。
    また、HLA-KMRを使用することで、移植後のレシピエントのHLA lossを検出することも可能です。


  • KMRtype®

  • ・キメリズムモニタリングのジェノタイピング用試薬です。
    ・18の染色体上の39マーカーから、レシピエント(またはドナー)特異的マーカーを選択します。
    ・マルチプレックスアッセイ(蛍光試薬: FAM, Orange 560, Red 610)を採用しています。
    ・Full kit以外にはqPCR用バッファーおよび酵素(KMRassay qPCR buffer & Enzyme)とReference Assay用試薬(KMRassay Reference Assay 901)が含まれていませんので、別売の試薬もご購入下さい。
    ※使用可能なqPCR装置はメーカーサイトでご確認下さい。


  • KMRtrack®

  • ・キメリズムモニタリングのモニタリング用試薬です。
    ・選択されたマーカーを使用し、移植後のレシピエントDNA(またはドナーDNA)の相対量を高感度にモニタリング可能です。
    ・シングルプレックスアッセイ(蛍光試薬: FAM)を採用しています。
    ・Starter Kit以外にはqPCR用バッファーおよび酵素(KMRassay qPCR buffer & Enzyme)とReference Assay用試薬(KMRassay Reference Assay 901)が含まれていませんので、別売の試薬もご購入下さい。


  • KMRengine®

  • ・KMRtypeおよびKMRtrackを用いたキメリズム解析用ソフトウェアです。
    ・HLA-KMR(下記)を用いた解析にもご使用いただけます。
    ・試験のセットアップからデータ解析および解析結果の出力まで、キメリズム解析のあらゆる工程をサポートします。
    ・Free Trial:無料で一定期間お試しいただけます。ご希望の場合は、メーカーサイトよりお申込みいただくか、弊社 “お問合せ”サイトよりご連絡ください。


  • HLA-KMR®

  • ・移植後のキメリズムをモニタリングする際に、レシピエント細胞のHLA loss(不一致HLAハプロタイプ特異的ゲノムロス)を検出するための製品です。
    ・レシピエント特異的HLAアリルマーカーを、HLA-A, -C, -DPB1のアリルグループを対象とした10マーカーから選択します。
    ・KMRtrackを用いたキメリズムモニタリングと並行して実施することで、白血病が再発した際に、HLA lossを伴っているかどうかを調べることが可能です。
    ・qPCR用バッファーおよび酵素(KMRassay qPCR buffer & Enzyme)とReference Assay用試薬(KMRassay Reference Assay 901)は別売です。



    KIRはナチュラルキラー(NK)細胞の表面に発現し、NK細胞の阻害と活性化を制御しています。あるKIRタンパク質がNK細胞の阻害のためにHLAクラスIと相互作用する一方で、他のKIRタンパク質はNK細胞の活性化を制御します。近年、組織適合性および免疫遺伝学の分野でKIRへの注目が高まっており、GenDx社ではアレルレベルでのジェノタイピングが可能な、次世代シーケンサーを用いたKIRタイピング用試薬と解析ソフトウェアを開発しました。
    現在、イルミナ社プラットフォームに対応したワークフローをご提案可能で、ワークフローの工程ごとに製品を提供しています。


    Amplification

      対象となるKIR遺伝子をPCR増幅するための試薬です。


    • NGS-go®-AmpX KIR

    • ・主な構成試薬:KIRの8遺伝子をターゲットとしたSingleplex増幅用プライマー、PCR試薬(GenDx-LongMix)。
      ・対象KIR遺伝子:KIR2DL1, KIR2DL2, KIR2DL3, KIR2DL4, KIR3DL1, KIR3DS1, KIR3DL2, KIR3DL3(今後対象遺伝子は追加予定)
      ・各KIR遺伝子の全長を増幅します
      ※各遺伝子座の対象領域はメーカーサイト でご確認下さい。


    Library preparation

      NGSライブラリを作製するための試薬です。


    • NGS-go®-LibrX

    • ・ライブラリ作製用試薬です(アダプターとIndex配列付プライマーは別売)。
      ・現在KIRタイピング用には、イルミナ社プラットフォームに対応したワークフローをご提案可能です。


    • NGS-go®-IndX

    • ・ライブラリ作製用アダプター&Index配列付プライマーです。
      ・イルミナプラットフォーム用(24, 96, 384 index)試薬をご提供します。


    • NGS-go®-IndX Adapters & Indices Illumina plates

    • ・ライブラリ作製用Index配列付プライマーの96ウェルプレートフォーマット製品です(アダプターも付属)。
      ・最大384種類のDual indexが使用可能です。
      ・より簡便で迅速なフローを実現すると共に、分注時のIndexの組み合わせ間違いを削減します。
      ・必要なサンプル数分のみ使用でき、未使用分は保存できます。


    Analysis software

      KIRタイピングのためのNGSデータ解析用ソフトウェアです。


    • NGSengine® & NGSengine® feature for KIR genes

    • ・NGSを用いたKIRタイピングのデータ解析とタイピング結果閲覧・判定のためのソフトウェアです。
      ・KIRタイピングのためにご使用いただく場合は、解析ソフトウェア(NGSengine)に加え、特別ライセンス(NGSengine feature for KIR genes)が必要です。
      ・通常のラップトップまたはデスクトップPCでお使いいただけます。
      ※ご使用頂く際は、メーカーサイト に記載のあるシステム要件を満たすPCをご準備下さい。



    本製品は、研究用試薬としてのみご利用いただけます。

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