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Tumor Mutation Burden (TMB)の算出
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バイオインフォマティクス
> Tumor Mutation Burden (TMB)の算出
特長
ヒト全ゲノムシークエンスやヒト全エクソームシーケンスの体細胞変異検出データを用いて、Exon領域1Mbaseあたりの体細胞変異数(腫瘍遺伝子変異量 Tumor Mutation Burden; TMB)を算出
TMB測定結果を表にまとめてご報告
解析例
Group ID
TMB
[Muts/Mb]
Region Size
[Mb]
Number of Variants
[Muts]
Group001
1.69
32.61
55
Group001
11.73
32.74
384
TMBの算出方法 TMB=Number of Variants[Muts]/Region Size[Mb]
弊社受託解析のオプションサービスとしてご利用の場合の必要条件
Human Whole Genome SequencingやHuman Exome SequencingのMatched-Pair解析
※これらの解析サービスに関しては、以下のページをご覧ください。
・Human Whole Genome Sequencing
・Human Exome Sequencing
本解析のみをご利用の場合の入力ファイル条件
BAMファイル及び、VCFファイル
※DRAGEN IT Platform以外で解析したデータの場合はお受け出来かねる場合がありますので、事前にご相談ください。
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