英国Oxford Gene Technology社（以下、OGT社）のSureSeq^™NGSパネルは、血液がんおよび固形がんに関係する重要な変異を検出するために、権威ある癌専門医と共同で設計された研究用NGSパネルです。さらに、SureSeq myPanel^™では、専門家が厳選し事前に最適化されたがんコンテンツから必要な遺伝子等を組み合わせていただくことにより、お客様の研究目的に合ったNGSがんパネルを自由に作成することが可能です。
※SureSeq^™はOxford Gene Technology社の商標です。

• 独自のパネル設計とハイブリダイゼーションベースのターゲット濃縮法の組み合わせにより、 比類のないカバレッジの完全性と均一性が実現され、低頻度SNVやindel、さらにはITD、PTD、CNV、LOH、転座などの構造異常（※1, 2）の 正確な検出が可能になりました。
• 全てのSureSeqパネルには、使いやすい解析ソフトウェアであるInterpretが付属しており、 NGSデータの分析を容易にご自身で実施していただけます。
  
  ※1 ITD、PTD、CNV、LOH、転座などの構造変異の検出は、特定のパネルや遺伝子についてのみ対応可能です。
  ※2 略語｜SNV：single nucleotide variant、indel：insertion/deletion、ITD: internal tandem duplication、PTD：partial tandem duplication、 CNV：copy number variant、LOH：loss of heterozygosity

• SureSeq Myeloid Plus Panel

  急性骨髄性白血病 (AML), 骨髄増殖性腫瘍 (MPN), 骨髄異形成症候群（MDS）に関連する49遺伝子と4つの性染色体遺伝子のSNVおよびindelと重複変異であるFLT3-ITDおよびKMT2A-PTDを確実に検出します。
  
  対象遺伝子領域の情報
   ・アリル頻度2.5-5％までのSNVとindelを検出します。
   ・検出が難しいことで知られているFLT3-ITDおよびKMT2A-PTDも解析可能です。

• SureSeq Pan-Myeloid Panel

  急性骨髄性白血病 (AML), 骨髄増殖性腫瘍 (MPN), 骨髄異形成症候群（MDS）など、幅広い骨髄増性疾患に関連する70遺伝子の主要な変異を検出するために、著名ながん専門家からの意見をもとに設計されました。SNVおよびindelの他、重複変異であるFLT3-ITDおよびKMT2A-PTDも精度良く検出します。

   
  対象遺伝子領域の情報
   ・さまざまな骨髄性悪性腫瘍に関与する70遺伝子の主要な変異と4つの性染色体遺伝子を解析します。
   ・アリル頻度1％までのSNVとindelを検出します。
   ・FLT3-ITDおよびKMT2A-PTDも解析可能です。

• SureSeq CLL + CNV Panel

  慢性リンパ性白血病 (CLL) に関連する13遺伝子のSNV, indelおよび重要な5領域のコピー数異常 (CNV) の検出が可能です。

解析対象遺伝子と染色体領域

Genes	ATM, BIRC3, BRAF, BTK, CXCR4, KRAS, MYD88, NOTCH1, PLCG2, SAMHD1, SF3B1, TP53, XPO1
CNVs	17p (covering TP53), 11q (covering ATM), 13q (covering RB1/DLEU2/DLEU7), 6q (6q23.2-6q23.3 covering MYB), Trisomy 12

• ・アリル頻度1％までのSNVとindelが検出可能です。
  ・単一エクソンから遺伝子全体のCNVに加えて、染色体腕の欠失および染色体全体の増加（trisomy 12）も検出します。
  ・単一のアッセイでより包括的な遺伝変異解析が可能です。

• SureSeq Core MPN Panel

  骨髄増殖性腫瘍 (MPN) に関連する3遺伝子（JAK2, MPL, CALR）の4つのエクソン領域の体細胞変異を検出するために、著名ながん専門家と協力して設計されました。

解析対象遺伝子領域

Gene	Exon	Key variants
MPL	10	W515
CALR	9	insertions / deletions
JAK2	12	insertions / deletions, amino acid substitutions
JAK2	14	V617F

• ・アリル頻度1％までのSNVとindelが検出可能です。
  ・BCR-ABL融合遺伝子を検出するために、BCR-ABL転座コンテンツを追加してパネルをカスタマイズすることも可能です。

 

• SureSeq Germline Breast Cancer + CNV Panel

  乳がんおよび卵巣がんに関連するBRCA1およびBRCA2を含む7つの重要な遺伝子の全エクソンをターゲットにしたパネルです。 全遺伝子について、SNV, indelおよびCNVの検出が可能です。
  
  対象遺伝子：ATM, BRCA1, BRCA2, TP53, CHEK2, PALB2, PTEN
   ・すべてのエクソン領域の生殖細胞系列変異を確実に検出します。
   ・単一エクソンの欠失から遺伝子全体の欠失や重複に至るCNVを検出します。

 

• SureSeq myPanel NGS Custom Cancer Panels

  定期的に更新され、専門家によって厳選、最適化されたがんパネルコンテンツのライブラリ（SureSeq myPanel: 最大210遺伝子）から必要な遺伝子を組み合わせるだけで、NGSがんパネルを作成できます。ハイブリダイゼーションベースのターゲット濃縮法とOGT社独自のパネル設計により、比類のないカバレッジの完全性と均一性を持つパネルをご提供致します。

  対象遺伝子の情報：SureSeq myPanel
  がん種ごとにプレデザインされたパネルをカスタマイズして、ご利用いただけます。
  FFPE由来サンプルの場合は、SureSeq FFPE DNA Repair Mixと組み合わせてご使用ください。

• SureSeq myPanel NGS Custom AML Panel

  急性骨髄性白血病（AML）に関連する29遺伝子の中から組み合わせが可能です。
  対象遺伝子：ASXL1, BCOR, BCORL1, CBLB, CBLC, CEBPA, CUX1, DDX41, DNMT3A, ETV6, FLT3, GATA1, IDH1, IDH2, IKZF1, IRF1, JAK3, KIT, KMT2A, KRAS, NPM1, NRAS, PHF6, RUNX1, SMC1A, TET2, TP53, U2AF1, WT1

• SureSeq myPanel NGS Custom Breast Cancer Panel

  乳がんに関連する24遺伝子の中から自由に組み合わせが可能です。
  対象遺伝子：APC, ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CDK12, CHEK2, EGFR, ERBB2, ESR1, GATA3, MSH6, NBN, PALB2, PIK3CA, PTEN, RAD51C, RAD51D, RB1, SF3B1, STK11, TP53

• SureSeq myPanel NGS Custom Colorectal Cancer Panel

  大腸がんに関連する16遺伝子の中から自由に組み合わせが可能です。
  対象遺伝子：APC, BRAF, CDH1, CHEK2, CTNNA1, ERBB2, HRAS, KRAS, MET, MSH6, NRAS, PIK3CA, PTEN, SMAD4, STK11, TP53

• SureSeq myPanel NGS Custom Melanoma Cancer Panel

  メラノーマに関連する4遺伝子の中から自由に組み合わせが可能です。
  対象遺伝子：BRAF, NRAS, KIT, NF1

• SureSeq myPanel NGS Custom Prostate Cancer Panel

  前立腺がんに関連する4遺伝子の中から自由に組み合わせが可能です。
  対象遺伝子：ATM, BRCA1, BRCA2, PALB2

• Universal NGS Complete Workflow Solution

  合理化されたワークフローにより、以前の製品よりもハンズオンタイムが短縮されました。さらに、独自のUnique Dual Index (UDI) ストラテジーが採用され、インデックスホッピングによるサンプルインデックスのミスアサインメントを回避し、正確なdemultiplexingを保証しています。また、Unique Molecular Identifier (UMI) を使用することで、低頻度バリアントを確実に検出します。
  本製品の詳細に関しましてはこちら もご参照ください。
  
  ・構成試薬：ライブラリ作製試薬（Universal Library Preparation Kit）、インデックスアダプタープレート（Universal Index Adapters）、ターゲット濃縮用試薬（Universal Hybridization & Wash Kit）、DNA精製用試薬（Universal Bead Kit）
  
  ※本製品は血液や骨髄を含む組織から抽出されたDNAを使用したNGSパネル解析に適しています。固形腫瘍（FFPE）サンプルをご使用の場合は、下記の製品（SureSeq NGS Library Preparation Kit）をご使用いただくことを推奨しております。

• SureSeq NGS Library Preparation Kit for soild tumour samples

  高いオンターゲット率および低重複率を可能とする高性能なライブラリ調製キットです。固形腫瘍（FFPE）サンプルを用いてSureSeqパネルを使用したNGS解析を実施される際にご使用ください。
  
  ・構成試薬（SureSeq NGS Library Preparation Complete Solutionの場合）：ライブラリ作製試薬（SureSeq NGS Library Preparation Kit、SureSeq NGS Index Kit）、ターゲット濃縮用試薬（SureSeq NGS Hyb & Wash Kit、Dynabeads M270 Streptavidin）、DNA精製用試薬（AMPure XP beads）

• SureSeq FFPE DNA Repair Mix

  FFPE由来DNAの広範囲の損傷を修復するように最適化されたenzyme mixtureであり、 固定や長期保存によって引き起こされるアーティファクトを除去します。 NGSライブラリの収量、オンターゲット率および平均ターゲットカバレッジが向上します。

• Interpret NGS Analysis Software

  全てのSureSeqパネルに付属する無償の解析ソフトウェアです（※１）。 低頻度のSNVおよびindelから、CNVや転座を含む大きな構造異常に至るまでの変異を確実に検出します（※２）。 カスタムメイドのバリアントフィルタリングオプションをデータ解析プロトコールに組み込むことができ、 解析基準に合わせてバリアント検出を最適化できます。
  
  ※１ ご使用頂く際は、 メーカーサイト に記載されたシステム要件を満たすPCをご準備下さい。
  ※２ CNV、転座などの構造変異の検出は、特定のパネルや遺伝子についてのみ対応可能です。

本製品は、研究用試薬としてのみご利用いただけます。