TrueBac™ ID-Genome / TrueBac™ ID-16S
特長
・独自のデータベース（TrueBac™データベース）を使用し、全ゲノム配列または16S rRNA配列から細菌を同定可能なクラウドサービス。
・データベースに含まれる全ゲノム配列および16S rRNA配列は、すべて、細菌分類学の専門家により確認済。
・TrueBac™ID Webサイトへアクセスし、データをアップロードするだけで、簡単に細菌を同定することが可能。
・抗微生物薬耐性遺伝子と病原性因子も検出※。
※TrueBac™ ID-Genomeサービスのみ。
解析概要
TrueBac™ IDは、独自のデータベースを使用し、全ゲノム配列または16S rRNA配列から細菌を同定可能な、ChunLab社のクラウドサービスです。
TrueBac™データベースには、type strainやreference strainの全ゲノム配列、およびspeciesまたはsub speciesレベルで分類可能な16S rRNA配列が含まれ、すべての配列が細菌分類学の専門家により確認されています。
TrueBac™ IDは、臨床や製造の分野で重要性の高いほとんどの細菌が網羅され、ゲノムおよび16S rRNA配列を元にそれらを正確に同定します。
○TrueBac™ データベースの特徴
・分類学上検証された1万以上のspeciesまたはsub speciesの精選された全ゲノムデータを搭載。
・月毎のアップデート時に、文献等に記述のある100以上の新種を追加。
・公的なデータと独自に作成されたデータを組み合わせ、質と信頼性を担保。
○ワークフロー
① Webサイトへアクセスし、ログインします。
※EzBioCloudのアカウントをお持ちでない場合は、新規登録が必要です。
② 塩基配列データ（FASTA）またはNGSデータ（FASTQ）をアップロードし、解析をスタートさせます。
③ 解析結果をサイト上で閲覧します。
サービス内容
| サービス名 | TrueBac™ ID-Genome | TrueBac™ ID-16S |
|---|---|---|
| 解析対象データ | 全ゲノム配列 （0.5-16 Mb） | 16S rRNA遺伝子 |
| シーケンシング方法 | NGS （Illuminaなど） | Sanger |
| インプットデータフォーマット | FASTA（Assembled contigs）, FASTQ (Raw data) | FASTA |
| 細菌の同定基準 | 95-96% average nucleotide identity (ANI) | 98.7% sequence similarity |
| 1データ当たりの処理時間 | Minutes | Minutes |
| 特記事項 | 抗微生物薬耐性遺伝子と 病原性因子の検出が可能 | － |
解析結果
TrueBac™ ID Webサイト上で、下記の解析結果を閲覧していただけます。また、解析結果はExcelフォーマットでダウンロード可能です。
TrueBac™ ID-Genome
・細菌種の同定結果
・全ゲノム配列から選抜された細菌種候補リスト（ANI, 16S rRNA/recA/rplC similarity, Taxonomyなどの情報が付与）
・抗微生物薬耐性遺伝子（Antimicrobial resistance gene）の検出結果
・病原性因子（Virulence factors）の検出結果
TrueBac™ ID-16S
・細菌種の同定結果
・16S rRNA配列から選抜された細菌種候補リスト（Similarity, Diff/Total nt,Taxonomyなどの情報が付与）
・塩基配列のAlignment結果
トライアル
TrueBac™ ID-GenomeおよびTrueBac™ ID-16Sサービスを無料で一定期間お試しいただけます。
ご希望の場合は、下記情報を弊社お問い合わせフォームからご連絡ください。
- お名前
- ご所属
- E-メールアドレス
- ご希望のサービス名（TrueBac ID-16S、 TrueBac ID-Genome）
- ご希望の開始日
また、TrueBac™ IDの詳細は、ChunLab社のUserGuideサイトでもご確認いただけますので、ご参照ください。