マイクロアレイ
メチル化解析
- がんやその他の疾患、環境曝露、加齢による エピジェネティックな変化を検出します。
- 1塩基レベルでのDNAメチル化定量ができます。
- 一部のSNP解析もできます。
- 多様なマウス系統に対応し、28万以上のメチル化サイトを高解像度で解析します。
弊社では下表3種のIllumina社のBeadChipを用いてDNAメチル化解析を受託しています。
| Infinium Methylation Screening Array (MSA) |
Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip (EPIC) |
Infinium Mouse Methylation BeadChip |
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| こんな方に おすすめ |
既知の疾患・形質関連CpGを中心に設計された高精度メチル化解析ツール。 コスト効率と再現性に優れ、大規模研究に有用。疫学研究や環境曝露研究などのエピゲノムワイド関連研究（EWAS）に適しています。 ・公衆衛生 ・疫学研究 ・老化研究など |
疾患関連研究や機能ゲノミクス解析に適したDNAメチル化解析ツール。 プロモーターやエンハンサーを含む広範囲のCpGを高精度に解析可能。 網羅的なCpGカバレッジにより、探索的メチル化研究に適しています。 ・がん研究 ・希少疾患研究など |
多様なマウス系統にを対象に、ゲノムワイドなDNAメチル化解析を可能にするツール。 疾患モデル、遺伝子改変マウス、環境曝露研究など、幅広いエピジェネティック研究に適しています。 ・前臨床研究 ・遺伝子改変マウス解析 ・疾患モデル研究など |
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| サイト数 | 約27万 | ・CpG：262,470 ・CpH：2,776 ・SNP rsID：3,848 疾患関連CpGに最適化 |
約93万 | ・CpG：926,849 ・CpH：2,914 ・SNP rsID：538 広範囲のCpGを網羅 |
約28万 |
- ※ このデータをRG独自開発のAnnotationViewerで読み込むことにより、UCSC Genome Browserなどの外部サイトと連携できます。
納品物
- 解析報告書
- データディスク: メチル化定量データ（txtファイル）、グループ間比較解析データ （txtファイル）、クラスタリング解析データ（bmp画像ファイル）
| サンプル種 | ゲノムDNA※1 (ヒトの場合※2：血液、組織※3 、唾液) |
|---|---|
| 必要DNA量 | 500 ng以上 (バイサルファイト処理前※4 ) |
| 必要DNA溶液量 | 40 µL以上 |
| 溶出バッファー | 1xTE |
| バイサルファイト処理 | Zymo Research社 EZ DNA Methylation KitまたはEZ DNA Methylation-Goldを推奨 |
| 納期 | 品質評価通過後、約6週 (試薬手配期間は除く) |
- ※1 検体提出の詳細やDNA抽出をご希望 される場合は、別途お問合せください。
- ※2 マウス由来検体の場合は別途ご相談ください。
- ※3 EPICおよびマウス用BeadChipでは、FFPEサンプルを用いた解析も可能です。
- ※4 バイサルファイト処理済みのサンプルも受入れ可能です（サンプルの品質評価は実施しません）。