Microarray Genotyping Analysis-Illumina-

特長

・圧倒的な実績(数量)及び、経験豊富なスタッフによる安心のサービスとサポートのご提供
・世界トップクラスの解析ラボ(完全自動化解析、LIMS採用により解析操作の均一性とミスハンドリングの根絶を実現)
・充実の信頼性保証体制(IlluminaPropel認証)の確立
・株式会社スタージェン社との提携による小家系連鎖解析のご提供

解析概要

弊社は、最先端のゲノムコンテンツをカバーするSNPジェノタイピングツールとして、Illumina社のInfiniumビーズチップを採用し、受託解析サービスをご提供しております。最近では次世代シーケンスサービスとのデータ統合による、より正確なバリデーションやスクリーニング目的の利用が増加してきております。信頼性保証体制を整えた世界最大級の遺伝子受託解析ラボにて、豊富な実績に加え独自の実験管理システムにより高品質データをご提供いたします。小規模プロジェクトから大規模プロジェクトまで安心してご利用ください。

代表的なチップ

 

ヒト用チップ

 
チップ名特徴
Infinium Global Screening Array複数人種集団向けにパワーを発揮、クリニカルリサーチ向けの
多型を網羅的にカバー・約64万マーカー搭載
Infinium Asian Screening Arrayアジア特異的な低頻度の遺伝的多型やクリニカルコンテンツ
までカバー・約75万マーカー搭載
【Omniシリーズ】
InfiniumOmin5
InfiniumOmin2.5
InfiniumOminExpressExome
InfiniumOminExpress
優れた検出力で比類ないカバレッジを提供
約430万マーカー搭載
約250万マーカー搭載
約95万マーカー搭載
約71万マーカー搭載
InfiniumCore有益なtagSNPの搭載による高効率化・約30万マーカー搭載
InfiniumExomeヒトのエクソン領域にフォーカス・約24万マーカー搭載
InfiniumCytoSNP-850KCytogenesis研究用・約85万マーカー搭載
Human CytoSNPCytogenesis研究用・約29万マーカー搭載
※ その他チップをご希望の場合は別途お問い合わせください。

動植物用チップ

 
チップ名特徴
BovineHDウシ高密度SNP解析用・約78万マーカー搭載
BovineSNP50ウシSNP解析用・約5.4万マーカー搭載
BovineLDウシ低密度SNP解析用・約8千マーカー搭載
PorcineSNP60ブタSNP解析用・約6.4万マーカー搭載
CanineHDイヌ高密度SNP解析用・約17万マーカー搭載
※ その他チップをご希望の場合は別途お問い合わせください。

解析結果

 

解析結果

納品物

ジェノタイプデータ(csvファイル)
GenomeStudioデータ(bscファイル)
アノテーションデータ(csvファイルまたはtxtファイル)
RAWデータ(idatファイル)
GenomeStudioデータ作成に必要なファイル一式

連鎖解析実施時は、以下のファイルも納品します。
候補領域リスト(bedファイル)
候補領域図(bmpファイル)

サンプル条件

サンプルの種類          精製ゲノムDNA          
DNA濃度50 ng/µL以上
液容量40µL
※基準に満たない場合は、良好なデータが得られない場合がございますので、ご相談ください。
また、チップによってはサンプル条件が異なる場合がございますのでお問い合わせください。

解析例

BeadChipInfiniumOmniExpressExome-8
機種iScan
サンプル数96
データ量  Rawデータ: 1.7GB GenomeStudioデータ: 2GB ジェノタイプデータ: 4GB  
バイオインドマティクス解析GenomeStudioデータ作成
GenomeStudioから各種ストランドで、ジェノタイプデータを出力
納期サンプル受領後、約1.0ヵ月(別途、試薬の手配に約1.0ヵ月かかります。)

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