Applied Biosystems™ GeneChip™アレイは、オートメーション製造プロセスにより作製され、また、ハイブリダイゼーション以降の操作が自動化されているため、チップ間のデータのばらつきが最小限に抑えられ、再現性の高い解析が可能です。発現解析用のアレイは、3’ IVT Array, Gene Array, Clariom™ D Array, Clariom™ S Arrayに分けられます。いずれのアレイにおいても、１つの転写産物の検出に複数のプローブを使用しています。3’ IVT Arrayは、遺伝子の3’末端側にプローブが設計されており、Gene Arrayは転写産物全長にわたってプローブが設計されています。Clariom™ D Arrayは、さらに高密度にプローブが設計され、選択的スプライシング解析などにも適しています。Clariom™ S Arrayは、Isoform間で共通するエクソンのプローブに絞り込むことで、遺伝子レベルでの解析に特化しています。

3’IVT Array
： 豊富な実績のあるマイクロアレイ

• Human Genome U133 Plus 2.0 Array
• Mouse Genome 430 2.0 Array
• Rat Genome 230 2.0 Array

Gene Array
： 3’バイアスのない新しいプローブデザイン

• Human Gene 2.0 ST Array
• Mouse Gene 2.0 ST Array
• Rat Gene 2.0 ST Array

Clariom™ D
： トランスクリプトームレベルの解析に

• Clariom™ D Array, Human
• Clariom™ D Array, Mouse
• Clariom™ D Array, Rat

Clariom™ S
： 遺伝子レベル解析専用の安価なアレイ

• Clariom™ S Array, Human
• Clariom™ S Array, Mouse
• Clariom™ S Array, Rat

• ● 3’IVT ArrayとGene Arrayについては ヒト・マウス・ラットのほかショウジョウバエ、線虫、酵母 シロイヌナズナ、イヌ、ウシなど多数の生物種に対応しています。

3’IVT Array、Gene ArrayおよびClariom™ S Arrayでは、標準で以下のベーシック解析を実施しています。また、オプション解析も承ります。

■ベーシック解析
GeneSpring^® GXを用いて以下の解析を実施します。

• スキャッタープロットの作成
• 発現変動遺伝子(Probe)の抽出
• GO解析^※

■オプション解析
GeneSpring^® GXを用いて以下の解析を実施します。

• クラスタリング解析＋ヒートマップ作成

Clariom™ Dでは、生データのみを納品いたします。データ解析に関しましては、Thermo Fisher Scientifics社のTranscriptome Analysis Console (TAC) Software^※を使用して、検体間での遺伝子発現比較解析等を行うことが可能です。

※ Transcriptome Analysis Console Softwareは、Thermo Fisher Scientifics社より無償でインストールする事が可能です。

Total RNA量	300 ng
Total RNA濃度	100 ng/µL以上
OD260/280	1.8～2.1
RIN値	7以上

※ 上記条件を満たさない場合はご相談ください。

使用アレイ	Human Genome U133 Plus 2.0 Array
サンプル数	6（コントロール:3、比較サンプル:3）
データ解析	GeneSpring GXによるベーシック解析
納期	品質評価通過後、約2.0ヶ月