ロングリードシーケンスを用いた全ゲノム解析
特長
- 数万塩基に及ぶリード長。
- PacBio HiFi Library(ライブラリー調整試薬)とPacBio社Revio(シーケンス装置)を用いたロングリードシーケンスを実施。
- SNV、Indel、CNV、フェージング、 転座、逆位、リピート伸長の変異が検出可能。
- 他の技術ではアクセスできない領域*をシーケンシングできるため、均一なカバレッジの取得が可能。
(* 高 AT 含量または高 GC 含量の領域、反復性に富む配列、長いホモポリマー領域、パリンドローム配列) - より複雑なゲノム内の構造変異(SV)を検出。
- ハプロタイプとして知られる各染色体の異なるコピー(例えば、二倍体の場合は母方と父方)を分離可能。
- シーケンス時にDNAメチル化の情報も同時に取得できるため、エピジェネティック研究にも有用。
解析概要

納品物
- 解析報告書
- データHDD:hifi_reads.bam/pbi、hifi_reads.fastqおよびxmlを含むRaw data
- ※ ロングリードシーケンスのデータ解析をご希望の場合は、別途ご相談ください。
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サンプル条件
サンプル | 精製ゲノムDNA※ |
---|---|
DNA量 | 7.6 µg |
DIN値 | 7 以上 |
溶媒 | EDTA、2価の金属陽イオン、変性剤、界面活性剤を含まないバッファーを推奨 |
- ※ DNAの抽出はロングリード用の試薬キットを推奨します。
- ※ 推奨キットや核酸抽出サービスに関しては、弊社までお問い合わせください。
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