ゲノム配列未知のバクテリアを対象として、全ゲノムの塩基配列を決定します。複数機種の次世代シーケンサー（NGS）をご用意していますので、研究目的に適したシーケンシング方法が選択可能です。ゲノムの機能解析、進化、比較ゲノムや薬品開発・エネルギー産業研究に応用していただけます。

解析データは、オリジナルウェブツールEzBioCloud Whole Genome Analysis (WG)^※1およびComparative Genomics (CG)^{※1, 2}を利用して、下記の内容を閲覧・分析していただけます。

■ Whole Genome Analysis：サンプルごとの全ゲノムシーケンシング解析

• de novoアセンブリングによるコンティグ作成
• 予測されたCDSへのアノテーション付与
• 予測されたCDSのゲノムブラウザおよびゲノムマップ表示
• BLASTを用いたホモログ探索

■ Comparative Genomics：お客様ご提供のゲノム配列及び公共データベース上のゲノム配列を用いた比較解析（オプション）

• ゲノム配列間の類似性を基に作成された系統樹
• リファレンスと任意のゲノム配列間の遺伝子ごとの類似性
• 複数ゲノム配列間で共通に存在する遺伝子の数
• 遺伝子構成によるクラスタリング解析とヒートマップ作成（Gene presence/absence analysis） など

• ※1 ご使用になる際は、WebブラウザとしてGoogle Chromeの使用を推奨します。
• ※2 詳細はCJ Bioscience社ホームページのサイトをご参照ください。

機種	MiSeq	PacBio
サンプルの種類	精製ゲノムDNA	精製ゲノムDNA※1
DNA量	1 µg	20 µg
DNA濃度※2	50 ng/µL以上	150 ng/µL以上
溶液量	20 µL以上	20 µL以上
OD260/280	1.8以上	1.8以上
溶媒※3	10 mM Tris-HCl (pH 8.5) またはNuclease-free水	10 mM Tris-HCl (pH 8.5) またはNuclease-free水

• ※1 分解の見られないゲノムDNAをご提出ください。
• ※2 サンプルの定量はQubitまたはPicoGreenを用いた方法を推奨しております。
• ※3 EDTAを含まないバッファーを溶媒としてご使用ください。

解析内容	5 Mb以下ゲノムのドラフトシーケンシング
機種	Miseq
リード長	300 bp
シーケンス方法	Paired End
バイオインフォマティクス解析	アセンブリングによるコンティグの作成、コンティグ上のORF予測、 予測されたORFへのアノテーションなど