Library Sequencing

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特長

・様々な次世代シーケンスプラットフォームを用いたシーケンスのみのサービス。
・ライブラリーDNAを受理後、短期間でシーケンスデータをご提供。
・ハイスループットなシーケンス解析を１解析単位（１レーンまたは１ラン）からお手頃な価格でご提供。

解析概要

NovaSeq/HiSeq/NextSeq/MiSeq（Illumina社）およびIon S5TMシステム（ThermoFisher Scientific社）を用いて、ハイスループットなシーケンス解析を実施します。お客様自身でライブラリー調製を行っていただくことで、次世代シーケンス解析をお手頃な価格でご利用いただけます。

解析概要（図）

解析内容

機種 シーケンシング試薬
またはチップ※1		 リード長 ペアエンド／
シングルエンド		 リード数（データ量）※2
NovaSeq 6000 S4試薬 150 bp ペアエンド 約5B（約750 Gb）/レーン
NovaSeq 6000 S2試薬 150 bp ペアエンド 約6.6B（約1000 Gb）/ラン
NovaSeq 6000 S1試薬 150 bp ペアエンド 約2.6B（約400 Gb）/ラン
NovaSeq 6000 SP試薬 150 bp ペアエンド 約1.3B（約200 Gb）/ラン
NextSeq High Output v2.5試薬 150 bp ペアエンド 約660M（約100 Gb）/ラン
NextSeq Mid Output v2.5試薬 150 bp ペアエンド 約220M（約33 Gb）/ラン
MiSeq V3試薬 300 bp ペアエンド 約44M（約13 Gb）/ラン
MiSeq V2試薬 150 bp ペアエンド 約24M（約3.6 Gb）/ラン
Ion S5TM Ion 540チップ ～200 bp シングルエンド 約60M/ラン
※１　上記以外のシーケンシング試薬またはチップを使用した解析をご希望の場合は、別途ご相談ください。
※２　上記リード数およびデータ量は、目安の数値であり、それらを保証するものではありません。

納品物

・解析報告書
・データHDD：シーケンスデータ（FASTQファイルなど）

サンプル条件

プラットフォームNovaSeq/NextSeq/MiSeqIon S5TM
サンプルの種類プールされたライブラリーDNA※1プールされたライブラリーDNA※1
DNA濃度※210 nM 以上1 nM 以上
溶液量15 μL 以上20 μL 以上
推奨ライブラリーサイズ※3300-700 bp250-350 bp
溶媒各社推奨バッファー各社推奨バッファー
※１　１レーンまたは1チップ分を1チューブにプールしたものをご提出ください。
※２　サンプルの濃度測定は、qPCR法により、各社のプロトコールに従い実施することを推奨しております。
※３　プーリング前のライブラリDNAに関して、Agilent 2100バイオアナライザを用いた解析結果がお手元にある場合は提出をお願いいたします。

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