Library Sequencing
特長
・様々なプラットフォームを用いた次世代シーケンス解析サービスをご提供。
・ライブラリーDNAからのシーケンス解析を短期間でご提供。
・ハイスループットなシーケンス解析を１解析単位（１レーンまたは１ラン）からお手頃な価格でご提供。
解析概要
NovaSeq/HiSeq/NextSeq/MiSeq（Illumina社）およびIon S5TMシステム（ThermoFisher Scientific社）を用いて、ハイスループットなシーケンス解析を実施します。お客様自身でライブラリー調製を行っていただくことで、次世代シーケンス解析をお手頃な価格でご利用いただけます。
解析内容
| 機種 | シーケンシング試薬 またはチップ※1 | リード長 | ペアエンド／ シングルエンド | リード数（データ量）※2 |
|---|---|---|---|---|
| HiSeq 2500 | Rapid v2試薬 | 100 bp | ペアエンド | 約250M（約25 Gb）/レーン |
| HiSeq 2500 | V4試薬 | 100 bp | ペアエンド | 約450M（約45 Gb）/レーン |
| NovaSeq 6000 | S4試薬 | 150 bp | ペアエンド | 約5B（約750 Gb）/レーン |
| NextSeq | Mid Output v2.5試薬 | 150 bp | ペアエンド | 約220M（約33 Gb）/ラン |
| NextSeq | High Output v2.5試薬 | 150 bp | ペアエンド | 約660M（約100 Gb）/ラン |
| MiSeq | V2試薬 | 150 bp | ペアエンド | 約24M（約3.6 Gb）/ラン |
| MiSeq | V3試薬 | 300 bp | ペアエンド | 約44M（約13 Gb）/ラン |
| Ion S5TM | Ion 540チップ | ～200 bp | シングルエンド | 約60M/ラン |
※２ 上記リード数およびデータ量は、目安の数値であり、それらを保証するものではありません。
納品物
・解析報告書
・データHDD：シーケンスデータ（FASTQファイルなど）
サンプル条件
| プラットフォーム | NovaSeq/HiSeq/NextSeq/MiSeq | Ion S5TM |
|---|---|---|
| サンプルの種類 | プールされたライブラリーDNA※1 | プールされたライブラリーDNA※1 |
| DNA濃度※2 | 10 nM 以上 | 1 nM 以上 |
| 溶液量 | 15 μL 以上 | 20 μL 以上 |
| 推奨ライブラリーサイズ※3 | 300-700 bp | 250-350 bp |
| 溶媒 | 各社推奨バッファー | 各社推奨バッファー |
※２ サンプルの濃度測定は、qPCR法により、各社のプロトコールに従い実施することを推奨しております。
※３ プーリング前のライブラリDNAに関して、Agilent 2100バイオアナライザを用いた解析結果がお手元にある場合は提出をお願いいたします。
関連サービス
Human Whole Genome Sequencing
Exome Sequencing
Target DNA Sequencing
Transcriptome Sequencing