ある特定の疾患を持つグループと健常者グループにおけるゲノム中のSNPを網羅的に比較・分析します。およそ数百～数千人の疾患群および対象群に対して、10万～100万個程度のSNPを調査します。

• 解析結果報告書
  • SNP imputationに関する報告書
  • 関連解析に関する報告書
• 解析結果表
  • QC結果
  • GWAS結果（P<5E-08を満たす、あるいはTop 100）
• 解析結果図
  • マンハッタンプロット
• 解析結果データ
  • SNP imputation結果
    
    • ※ ただし公的ゲノムコホートをスタージェンが取得した場合は、公的ゲノムコホートデータのSNP imputation結果は納品不可
  • GWASサマリー
    
    • ※ 全SNPのGWAS結果

オプション追加解析

• Regional plotの作図
  SNPの物理的位置の範囲、あるいは遺伝子名をしていただければRegional plotを描画します。
• Rare-variant/Gene-wise解析
  複数のSNPを統合的に評価する解析手法で、統合方法についてはご相談ください。
• 論文作成支援
  GWAS論文の作成支援を行います。

弊社受託解析のオプションサービスとしてご利用の場合

1. 全ゲノムデータ（以下のいずれかの解析で得られたデータ）
   
   • SNPジェノタイピング解析
     詳細はこちら
   • Human Whole Genome Sequencing（HWGS、全ゲノム解析）
     詳細はこちら
2. 各サンプルのGWASで比較したい臨床情報、および背景情報
3. 比較する群間で補正した背景情報：年齢、性別など

• ※ 公的ゲノムコホートデータの利用を希望する場合は、スタージェン社の公的ゲノムコホートデータの利用申請代行サービスをご利用いただき、データを取得します。

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