Fusion Gene Analysis
特長
- RNA-Seqにより取得されたペアエンドリード配列を用いて、融合遺伝子を検出
- 発現している融合遺伝子を効率良く探索
- Transcriptome Sequencingと組み合わせた解析も可能
解析概要
解析結果
検出された融合遺伝子の情報(Pfam domain、インフレームか否かの判定結果、breakpoint前後の配列、ゲノム位置などの詳細情報)をサマリーレポートと検出結果リストで、支持リードの状況をHTML形式のファイルでご提出します。
納品物
- 解析報告書
- データHDD: リード情報(FASTQ)、サマリーレポート(PDF)、検出結果リスト(Excel)、支持リード情報(HTML)
解析例
ライブラリ作製キット | TruSeq Stranded mRNA Library Prep |
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機種 | NovaSeq 6000 |
平均データ量/サンプル | 約100M リード以上 |
シーケンス方法 | Paired End/Multiplex |
バイオインフォマティクス解析 | 融合遺伝子の探索 |
納期 | 品質評価通過後、約3ヵ月※ |
※ 同時に解析を行うサンプル数が多い場合には、別途お打ち合わせの上決定いたします。