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ウイルス挿入位置の探索

特長

  • ヒトゲノムまたはマウスゲノムにおける、特定のウィルス配列の挿入位置を推定
  • イルミナ社が提供する解析ソフトDRAGENを使用し、高精度な解析を実現

解析概要

ご提供いただいたヒトゲノムまたはマウスゲノムのシーケンスデータとウイルス配列をもとに、ゲノム上でのウイルス配列の挿入位置を探索します。
解析概要フロー図

解析例

解析例

解析に必要な入力ファイル条件

  • ヒトゲノムまたはマウスゲノムのシーケンスデータ(FASTQファイル)
  • ウイルスの配列やベクター配列(txtファイル)

  • ※ 既知のウイルス配列のみ対応可能です。
  • ※ ゲノムシーケンスのデータがお手元にない場合は弊社でご提供しているWhole Genome Sequencingを先に実施してください。
    Whole Genome Sequencingについてはこちら

納品物

  • 解析報告書(PDF:ウイルス配列挿入位置の推定リスト、ウイルス配列挿入位置のIGV画像を掲載)
  • マッピングデータ(BAM)、SV検出データ(VCF)、SVのアノテーションデータ(エクセル・マクロファイルとテキストファイル)

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