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HLA(Human Leukocyte Antigen) typing

特長

  • HLAクラスI(HLA-A、HLA-B、HLA-C)およびクラスII(HLA-DRB1、HLA-DQB1など)の広範な遺伝子を網羅的に解析します。
  • 移植医療や疾患研究など幅広い分野のご研究にご活用いただけます。
  • 弊社のネオアンチゲン探索サービスと組み合わせてご使用いただけます。

解析概要

イルミナ社の提供する解析ソフトウエア「DRAGEN」を用いて、Human Whole Genome Sequencing(HWGS、全ゲノム解析)または、Human Whole Exome Sequencing(HWES、がんエクソーム解析)のデータをもとにHLA型を第二区域まで推定します。

解析結果

HLA型の推定結果を表にまとめてご報告します。

解析例

Class I HLA
A1 A2 B1 B2 C1 C2
A*02:05 A*02:05 B*15:220 B*50:01 C*06:02 C*12:03

Class II HLA
DQA11 DQA12 DQB11 DQB12 DRB11 DRB12
DQA1*02:01 DQA1*05:05 DQB1*03:01 DQB1*02:02 DRB1*11:01 DRB1*07:01

ClassI HLA(A, B, C)、ClassII HLA(DQA1, DQB1, DRB1)の各アレルのHLA型を示しています。
アレル頻度が高い方を1、低い方を2として示しています。各遺伝子座同士の1, 2には、特に対応関係はありません。

解析条件

  • 以下の弊社受託解析のオプションサービスとしてご利用の場合
    Human Whole Genome Sequencing(HWGS、全ゲノム解析)
    詳細はこちら
    Human Whole Exome Sequencing(HWES、がんエクソーム解析)
    詳細はこちら

  • 本データ解析のみをご利用の場合
  • ※ FASTQファイルのご提出をお願いします。
  • ※ 解析パイプラインによってはお受け出来ないことがありますので、事前にご相談ください。

納品物

  • 解析報告書
  • HLA型結果表

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