染色体組換ブレイクポイントの同定

特長

  • 同定された構造変異から染色体組換えのブレイクポイントを同定

解析概要

ご提供いただいたヒトゲノムまたはマウスゲノムのシーケンスデータとブレイクポイントの候補位置をもとに、染色体組換えのブレイクポイントの位置を推定します。

解析概要

解析例

解析例

解析に必要な入力ファイル条件

  • ヒトゲノムまたはマウスゲノムのシーケンスデータ(FASTQファイル)
  • 組換えが起こっている染色体のペアまたは、片方の染色体位置情報
注意事項:FISHなどで事前に確認済みであることが必須

※ ゲノムシーケンスのデータがお手元にない場合は弊社でご提供しているWhole Genome Sequencingを先に実施してください。
Whole Genome Sequencingについてはこちら

納品物

  • 解析報告書(PDF:BreakPoint位置の推定リスト、Breakpoint周辺のIGV画像を掲載)
  • マッピングデータ(BAM)、SV検出データ(VCF)、SVのアノテーションデータ(エクセル・マクロファイルとテキストファイル)

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