Microarray Methylation Analysis－Illumina－
マンハッタンプロット作成
特長
- Microarray Methylation Analysis－Illumina－の解析結果をマンハッタンプロットで作図
- 疾患の原因に関連する遺伝子や領域を視覚的にわかりやすく表示することができます
解析概要
Illumina社Infinium Methylation BeadChipを使用したDNAメチル化解析のデータを用いて、サンプル間（または群間）の比較解析を行います。その結果から染色体上の位置とその座位に対応する任意の値（P値、DiffScoreなど）をプロットし、画像ファイルにします。一定以上の数値のマーカについては画像内にマーカ名が表示されます。
解析例
【マンハッタンプロットの例】
Group1とGroup2の群間比較の結果から、各DNAメチル化領域における-log10(P値)（縦軸）と染色体上の位置（横軸）をマンハッタンプロットを用いて表した。DNAメチル化が優位に変化する領域が視覚的にわかりやすく表示される
本解析のご利用条件
- 弊社でのInfinium Methylation BeadChipの実施
※Infinium Methylation BeadChipの解析サービスに関しては、下記のページをご覧ください。
・SNPジェノタイピング解析
納品物
- クラスタリング解析定量データ(Excelファイル、txtファイル)
- クラスタリング解析マンハッタンプロットのデータ(pngファイル)